有一个女人，她没有孩子，就去求巫婆，求她让自己有一个孩子。巫婆给了她一颗种子，对她说：“你把它种在花盆，很快就会有孩子的。”女人回家照办了。不久，种子长出一朵很大的花，又不久，花开了，花蕊上面有一个很小很小的小女孩，她还没拇指一半大，因此大家都叫她拇指姑娘。女人高兴极了，她终于有了孩子，而且还是这么漂亮可爱的孩子。可是这么小的孩子该睡在哪里呢？她精心挑了个胡桃壳做摇篮，用花瓣做床垫和被子。晚上，拇指姑娘睡在摇篮里。白天，她就在桌子上玩。妈妈总是在旁边看着她。她们都感觉很幸福。但是有一天晚上，拇指姑娘睡觉的时候，一只癞蛤蟆跳进来，她看到拇指姑娘这么漂亮可爱，就把她带回家，给他儿子当老婆。癞蛤蟆把她放在水中一片荷叶上。拇指姑娘醒来时才发现这一切，她一点都不喜欢小癞蛤蟆，更不想和它结婚，于是她哭了。水中的鱼儿很同情她，就说：“趁它们不在，我帮你逃走吧！”鱼儿咬断了荷叶，荷叶载着拇指姑娘随波漂走了。这时有只金龟子看到了荷叶上的拇指姑娘，就把她抓起来，带到它树上的家。金龟子想和拇指姑娘结婚，但拇指姑娘一点都不喜欢它。这时金龟子小姐们来串门，她们很嫉妒漂亮的拇指姑娘，就故意说她丑。金龟子听信了它们的话，不要拇指姑娘了，就把她丢在森林里。幸亏森林里的田鼠婆婆愿意收留拇指姑娘。拇指姑娘给田鼠婆婆讲故事，把家里打扫得干干净净，相处得也挺快乐。

但是有一天，田鼠婆婆说：“我的邻居鼹鼠先生，虽然它是瞎子，但他有钱，你嫁给他，以后就不愁吃穿了。“但是拇指姑娘不喜欢鼹鼠，可是田鼠一定要她嫁，拇指姑娘变得闷闷不乐。有一天，拇指姑娘发现一只燕子冻僵了，晕倒在地。她给它盖上棉被，又生火让燕子暖和起来。在拇指姑娘的照料下，燕子康复了。它感谢拇指姑娘救了它，在交谈中，它知道了拇指姑娘的经历，知道了田鼠逼她嫁给鼹鼠。

燕子说：”你救了我的命，现在就让我帮你，我带你一起离开这里吧！“

于是，拇指姑娘爬上燕子的背，燕子带着拇指姑娘，飞过高山，飞过大海，来到一个温暖又开满鲜花的地方。燕子指着树上一个鸟窝说：“我们到了，这就是我的家，你看我家下面开着美丽的花朵，你选择一朵花做房子，我把你放上去，以后我们就是邻居了。”拇指姑娘选了一朵最美丽的花，燕子把她放了上去，可是拇指姑娘发现这朵花已经住了一个美男子，他和拇指姑娘一样大小，不同的是他有一对翅膀。原来这里的每朵花都住着一个小人，而这个小美男子是花中的王子。拇指姑娘一看到王子就喜欢他了，而王子也喜欢漂亮可爱的拇指姑娘。他们结婚了，其它花的主人都来送礼，他们送给拇指姑娘一对翅膀，从此，拇指姑娘就可以和王子一起在花间飞翔了，他们过得很快乐。